Yksi etninen ryhmä suhtautuu toisen uskonnon ryhmään vihamielisesti. Vaino ei viittaa oman klaanin kääntyneisiin kohdistuvaan sisäiseen painostukseen. Vaino ilmenee pääasiassa lukuisina väkivaltaisina yhteenottoina. Äärimmillään vaino johtaa uskonnolliseen puhdistukseen. Hyökkääjä yrittää kaikin keinoin tuhota vainon kohteeksi joutuneen ryhmän.
Esimerkkinä on väkivaltaisten aseistettujen fulanien toiminta monissa osissa Nigeriaa. He hyökkäävät pääasiassa kristityistä koostuvia yhteisöjä vastaan. Fulanit tappavat, vammauttavat ja raiskaavat ihmisiä sekä pakottavat heidät pakenemaan yhteisöistään. He tuhoavat maatiloja ja satoja, jotta yhteisön jäsenten olisi mahdotonta palata.
Tästä syystä toteutuva vaino koskee yleensä osaa maan alueista. Vaino voi myös ylittää kansalliset rajat etnisten ryhmien levinneisyyden mukaan.