Kristittyjen vainoa esiintyy Egyptissä tyypillisesti yhteisötasolla. Tapaukset vaihtelevat kadulla kävelevien naisten ahdistelusta aina kokonaisten uskovien yhteisöjen ajamiseen pois kodeistaan voimatoimin.
Vaikka maan hallitus puhuu kristityistä myönteisesti, hyökkäykset uskovia kohtaan jatkuvat, koska lainvalvonta on puutteellista.
Seurakunnat kohtaavat vaikeuksia yrittäessään rakentaa uusia toimitiloja. Syynä ovat valtion asettamat rajoitukset tai yhteisön vihamielisyys. Muslimista kristityksi kääntyneet joutuvat perheidensä vahvan painostuksen kohteiksi, jotta he palaisivat islaminuskoon.